Ketika BoBoiBoy FrostFire terperangkap di tangan Retak’ka, Gopal menyerahkan Ochobot kepadanya untuk mengambil Crystal Element Retak’ka. Retak’ka melawan balik sebagai Voltra, tapi Ying, Yaya dan Fang, yang dibebaskan oleh Papa Zola, membantu BoBoiBoy mengalahkan Retak’ka. Menolak untuk mengakui kekalahan, Retak’ka menyebut mereka “anak nakal” dan menggunakan bentuk Darkwood untuk mengambil bendungan di dekatnya. BoBoiBoy kemudian menggabungkan Elemen Gempa dan Esnya menjadi Gletser , menggunakan Raksasa Es untuk membekukan Retak’ka, sebelum mengambil kembali Elemen yang tersisa.
BoBoiBoy kemudian menggabungkan Thunderstorm dan Solar untuk membentuk Supra , menggunakan Super Supra Blast dia mengirim Retak’ka ke luar angkasa dalam kondisi mati. Setelah serangan itu, BoBoiBoy pingsan karena kelelahan, menyebabkan dia jatuh ke sungai dalam keadaan tidak sadarkan diri. Anggota geng BoBoiBoy lainnya mengambil BoBoiBoy dari sungai. Dia kemudian bangun di rumah sakit luar angkasa, di sebelah Adu Du, mengungkapkan rasa terima kasihnya kepada anggota gengnya yang lain. Tak lama kemudian, ia bertemu dengan sekelompok orang jamur, yang disebut oleh Koko Ci sebagai Suku Cendawa dari Planet Rimbara, yang akan mengawasi proses pembangunan kembali Bumi. Tok Aba , Mr Kumar , Mrs Wawa , Bibi Yang dan Mama Zila, yang marah karena Papa Zola membawa putrinya selama misi, mengunjungi BoBoiBoy. Hang Kasa mewariskan tanggung jawabnya dalam menangani 7 Elemen kepada BoBoiBoy, sebelum berbagi pelukan hangat.
Dalam adegan pasca-kredit, Maskmana menyerahkan Power Sphera, ArmoBotnya kepada Amato , yang memiliki CrystalBot dan EggaBot, untuk diperbaiki. Ketika Amato bertanya kepada Maskmana tentang mengapa dia tidak bergabung dalam perang melawan Retak’ka, dia kemudian menjawab bahwa Amato yang seharusnya membantu BoBoiBoy. Amato menyangkalnya, mengatakan bahwa BoBoiBoy harus mandiri karena ada misi yang lebih penting yang menunggunya.
Tamat.